Paket: sibsim4 (0.20-5)

Links für sibsim4

eLxr Patch-Überblick

Quellcode-Paket sibsim4 herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [sibsim4.sourceforge.net]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Andere Pakete mit Bezug zu sibsim4

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14)

GNU C Library: Shared libraries
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	29,7 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]