Paket: spoa (4.1.4-2 und andere)

Links für spoa

eLxr Patch-Überblick

Quellcode-Paket spoa herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere Pakete mit Bezug zu spoa

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C Library: Shared libraries
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

SIMD partial order alignment library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

spoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
arm64	4.1.4-2+b1	36,1 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]