Paketti: subread (2.0.8+dfsg-1)

Links for subread

eLxr Patch Tracker

Imuroi lähdekoodipaketti subread:

[subread_2.0.8+dfsg-1.debian.tar.xz]
[subread_2.0.8+dfsg-1.dsc]
[subread_2.0.8+dfsg.orig.tar.xz]

Ylläpitäjät:

Debian Med Packaging Team
Alexandre Mestiashvili
Andreas Tille

External Resources:

Kotisivu [sourceforge.net]

Samankaltaisia paketteja:

r-bioc-rsubread
hisat2
berkeley-express
berkeley-express-doc
python3-hisat2
salmon
malt
python3-htseq
crac
art-nextgen-simulation-tools
art-nextgen-simulation-tools-profiles

toolkit for processing next-gen sequencing data

Subread aligner can be used to align both gDNA-seq and RNA-seq reads. Subjunc aligner was specified designed for the detection of exon-exon junction. For the mapping of RNA-seq reads, Subread performs local alignments and Subjunc performs global alignments.

Muut pakettiin subread liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C Library: Shared libraries
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

compression library - runtime

Imuroi subread

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	792.3 kt	9,807.0 kt	[tiedostoluettelo]