Paquet : maq (0.7.1-10)

Liens pour maq

Suivis des correctifs pour eLxr

Télécharger le paquet source maq :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [maq.sourceforge.net]

Paquets similaires :

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Autres paquets associés à maq

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU Standard C++ Library v3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

compression library - runtime

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Télécharger maq

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	295,1 ko	545,0 ko	[liste des fichiers]