Paquet : delly (1.1.8-1 et autres)

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Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Autres paquets associés à delly

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recommandations

suggestions

enhances

dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

program options library for C++
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.1.8-1+b2	394,0 ko	1 200,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.1.8-1+b3	355,5 ko	1 172,0 ko	[liste des fichiers]