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[ ソース: bioperl-run ]
パッケージ: bioperl-run (1.7.3-9)
BioPerl wrappers: scripts
Contains scripts from the BioPerl-Run package. This package will also install all wrappable applications packaged in Debian. The ones that are not Free are "Suggested" by this package.
その他の bioperl-run 関連パッケージ
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- dep: bioperl (>= 1.7.4)
- Perl tools for computational molecular biology
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- dep: default-jdk-headless
- Standard Java or Java compatible Development Kit (headless)
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- dep: hyphy-pt
- パッケージは利用できません
- または hyphy-mpi
- パッケージは利用できません
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- dep: libbio-cluster-perl
- パッケージは利用できません
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- dep: libbio-eutilities-perl
- パッケージは利用できません
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- dep: libbio-featureio-perl
- パッケージは利用できません
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- dep: libbio-perl-run-perl (= 1.7.3-9)
- BioPerl wrappers: modules
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- dep: libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl
- パッケージは利用できません
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- dep: libbio-tools-run-remoteblast-perl
- パッケージは利用できません
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- dep: libsoap-lite-perl
- Perl implementation of a SOAP client and server
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- dep: libtest-requiresinternet-perl
- パッケージは利用できません
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- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
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- rec: amap-align
- Protein multiple alignment by sequence annealing
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- rec: bedtools
- suite of utilities for comparing genomic features
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- rec: bowtie
- Ultrafast memory-efficient short read aligner
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- rec: bwa
- Burrows-Wheeler Aligner
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- rec: clustalw
- global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
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- rec: emboss
- パッケージは利用できません
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- rec: exonerate
- パッケージは利用できません
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- rec: hmmer
- パッケージは利用できません
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- rec: infernal
- パッケージは利用できません
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- rec: kalign
- パッケージは利用できません
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- rec: lagan
- パッケージは利用できません
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- rec: mafft
- パッケージは利用できません
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- rec: maq
- パッケージは利用できません
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- rec: muscle
- パッケージは利用できません
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- rec: ncbi-blast+-legacy
- パッケージは利用できません
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- rec: ncoils
- coiled coil secondary structure prediction
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- rec: pal2nal
- パッケージは利用できません
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- rec: pftools
- パッケージは利用できません
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- rec: phylip
- パッケージは利用できません
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- rec: phyml
- パッケージは利用できません
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- rec: primer3
- パッケージは利用できません
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- rec: probalign
- パッケージは利用できません
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- rec: probcons
- パッケージは利用できません
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- rec: raxml
- パッケージは利用できません
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- rec: samtools
- パッケージは利用できません
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- rec: sim4
- パッケージは利用できません
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- rec: t-coffee
- パッケージは利用できません
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- rec: tigr-glimmer
- パッケージは利用できません
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- rec: wise
- パッケージは利用できません
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- sug: fasta3
- パッケージは利用できません
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- sug: gmap
- パッケージは利用できません
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- sug: trnascan-se
- パッケージは利用できません