eLxr packages [ bianca ]
[ ソース: microbiomeutil ]
パッケージ: nast-ier (20101212+dfsg1-6 など)
nast-ier に関するリンク
microbiomeutil ソースパッケージをダウンロード:
- [microbiomeutil_20101212+dfsg1-6.debian.tar.xz]
- [microbiomeutil_20101212+dfsg1-6.dsc]
- [microbiomeutil_20101212+dfsg1.orig.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [microbiomeutil.sourceforge.net]
類似のパッケージ:
NAST-based DNA alignment tool
The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.
The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.
NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.
その他の nast-ier 関連パッケージ
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- dep: cdbfasta
- Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: microbiomeutil-data
- Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools
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- rec: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools