パッケージ: tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-12 など)

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類似のパッケージ:

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood

TREE-PUZZLE (the new name for PUZZLE) is an interactive console program that implements a fast tree search algorithm, quartet puzzling, that allows analysis of large data sets and automatically assigns estimations of support to each internal branch. TREE-PUZZLE also computes pairwise maximum likelihood distances as well as branch lengths for user specified trees. Branch lengths can also be calculated under the clock-assumption. In addition, TREE-PUZZLE offers a novel method, likelihood mapping, to investigate the support of a hypothesized internal branch without computing an overall tree and to visualize the phylogenetic content of a sequence alignment.

その他の tree-puzzle 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libsprng2

SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

rec: tree-puzzle-doc

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

sug: phylip

package of programs for inferring phylogenies
sug: treetool

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アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	5.3~rc16+dfsg-12+b1	166.5 kB	401.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	5.3~rc16+dfsg-12+b1	152.4 kB	429.0 kB	[ファイル一覧]