eLxr packages [ bianca ]
[ aria ]
[ Pakiet źródłowy: cnvkit ]
Pakiet: cnvkit (0.9.9-2 i inne)
Odnośniki dla cnvkit
Pobieranie pakietu źródłowego cnvkit:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [cnvkit.readthedocs.org]
Podobne pakiety:
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
A command-line toolkit and Python library for detecting copy number variants and alterations genome-wide from targeted DNA sequencing. It is designed for use with hybrid capture, including both whole-exome and custom target panels, and short-read sequencing platforms such as Illumina and Ion Torrent.
Inne pakiety związane z cnvkit
|
|
|
|
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-joblib
- tools to provide lightweight pipelining in Python
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-pandas
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-pomegranate
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-pyfaidx
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-pysam
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-reportlab
- ReportLab library to create PDF documents using Python3
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-sklearn
- Python modules for machine learning and data mining - Python 3
-
- dep: r-bioc-dnacopy
- Pakiet niedostępny
Pobieranie cnvkit
| Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.9.9-2+b1 | 15 064,0 KiB | 69 065,0 KiB | [lista plików] |
| arm64 | 0.9.9-2+b1 | 15 068,5 KiB | 69 065,0 KiB | [lista plików] |