Pakiet: mafft (7.505-1)

Odnośniki dla mafft

Śledzenie łatek systemu eLxr

Pobieranie pakietu źródłowego mafft:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [mafft.cbrc.jp]

Podobne pakiety:

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

MAFFT is a multiple sequence alignment program which offers three accuracy-oriented methods:

 * L-INS-i (probably most accurate; recommended for <200 sequences;
   iterative refinement method incorporating local pairwise alignment
   information),
 * G-INS-i (suitable for sequences of similar lengths; recommended for
   <200 sequences; iterative refinement method incorporating global
   pairwise alignment information),
 * E-INS-i (suitable for sequences containing large unalignable regions;
   recommended for <200 sequences),

and five speed-oriented methods:

 * FFT-NS-i (iterative refinement method; two cycles only),
 * FFT-NS-i (iterative refinement method; max. 1000 iterations),
 * FFT-NS-2 (fast; progressive method),
 * FFT-NS-1 (very fast; recommended for >2000 sequences; progressive
   method with a rough guide tree),
 * NW-NS-PartTree-1 (recommended for ∼50,000 sequences; progressive
   method with the PartTree algorithm).

Inne pakiety związane z mafft

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

rec: blast2

Pakiet niedostępny
rec: libwww-perl

simple and consistent interface to the world-wide web
rec: lynx

classic non-graphical (text-mode) web browser
rec: ruby

Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

Pobieranie mafft

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 052,5 KiB	11 920,0 KiB	[lista plików]