Pakiet: gmap (2024-11-20+ds-2)

Odnośniki dla gmap

Śledzenie łatek systemu eLxr

Pobieranie pakietu źródłowego gmap:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [research-pub.gene.com]

Podobne pakiety:

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of

 * known splice sites and identify novel splice sites.
 * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).

GSNAP can align bisulfite-treated DNA.

Inne pakiety związane z gmap

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

compression library - runtime

Pobieranie gmap

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
arm64	6 907,0 KiB	61 267,0 KiB	[lista plików]