eLxr packages [ bianca ]
[ Pakiet źródłowy: macs ]
Pakiet: macs (3.0.2-1 i inne)
Odnośniki dla macs
Pobieranie pakietu źródłowego macs:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers
MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.
Inne pakiety związane z macs
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.14)
- dep: python3 (>= 3.13~)
-
- dep: python3-cykhash
- cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique
-
- dep: python3-hmmlearn
- unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models
-
- dep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
-
- dep: python3-numpy2-abi0
- pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy
- lub python3-numpy-abi9
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-sklearn
- Python modules for machine learning and data mining - Python 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
Pobieranie macs
| Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 3.0.2-1+b3 | 3 047,7 KiB | 8 250,0 KiB | [lista plików] |
| arm64 | 3.0.2-1+b3 | 2 788,5 KiB | 8 056,0 KiB | [lista plików] |