Пакет: ampliconnoise (1.29-10 и другие)

Ссылки для ampliconnoise

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код ampliconnoise:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons

AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:

Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences

Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.

Другие пакеты, относящиеся к ampliconnoise

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

high performance message passing library -- shared library
dep: mafft

Пакет недоступен

rec: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

Загрузка ampliconnoise

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1.29-10+b2	1 085,5 Кб	2 041,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.29-10+b2	1 074,0 Кб	2 401,0 Кб	[список файлов]