eLxr packages [ bianca ]
[ Источник: cyvcf2 ]
Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 и другие)
Ссылки для python3-cyvcf2
Исходный код cyvcf2:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14)
- GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.14)
- dep: python3 (>= 3.13~)
-
- dep: python3-click
- Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
-
- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
-
- dep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
-
- dep: python3-numpy2-abi0
- виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy
- или python3-numpy-abi9
- Пакет недоступен
Загрузка python3-cyvcf2
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.31.1-2+b3 | 886,6 Кб | 5 624,0 Кб | [список файлов] |