Пакет: python3-pyabpoa (1.5.3-1 и другие)

Ссылки для python3-pyabpoa

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код abpoa:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

adaptive banded Partial Order Alignment - python3 module

abPOA is an extended version of Partial Order Alignment (POA) that performs adaptive banded dynamic programming (DP) with an SIMD implementation. abPOA can perform multiple sequence alignment (MSA) on a set of input sequences and generate a consensus sequence by applying the heaviest bundling algorithm to the final alignment graph.

abPOA can generate high-quality consensus sequences from error-prone long reads and offer significant speed improvement over existing tools.

abPOA supports three alignment modes (global, local, extension) and flexible scoring schemes that allow linear, affine and convex gap penalties. It right now supports SSE2/SSE4.1/AVX2 vectorization.

This package provides the python3 module of abPOA.

Другие пакеты, относящиеся к python3-pyabpoa

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.33)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: python3 (<< 3.14)

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (>= 3.13~)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

Загрузка python3-pyabpoa

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
arm64	1.5.3-1+b4	144,2 Кб	413,0 Кб	[список файлов]