Пакет: blasr (5.3.5+dfsg-7 и другие)

Ссылки для blasr

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код blasr:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Другие пакеты, относящиеся к blasr

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg)

tools for aligning PacBio reads to target sequences
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libhdf5-cpp-310 (>= 1.14.4.3)

HDF5 - C++ runtime files - serial version
dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg)

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg)

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-9~)

library for analyzing PacBio sequencing data
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3

Загрузка blasr

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	5.3.5+dfsg-7+b1	232,8 Кб	700,0 Кб	[список файлов]
arm64	5.3.5+dfsg-7+b1	201,7 Кб	680,0 Кб	[список файлов]