eLxr packages [ bianca ]
[ Источник: covtobed ]
Пакет: covtobed (1.3.5+dfsg-2 и другие)
Ссылки для covtobed
Исходный код covtobed:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
convert the coverage track from a BAM file into a BED file
Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.
Другие пакеты, относящиеся к covtobed
|
|
|
|
-
- dep: bamtools
- toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: zlib1g
- compression library - runtime
Загрузка covtobed
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.3.5+dfsg-2 | 49,8 Кб | 146,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 1.3.5+dfsg-2+b1 | 45,0 Кб | 147,0 Кб | [список файлов] |