Пакет: murasaki (1.68.6-14 и другие)

Ссылки для murasaki

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код murasaki:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Подобные пакеты:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Другие пакеты, относящиеся к murasaki

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

Boost.Iostreams Library
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 14)

GNU Standard C++ Library v3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Загрузка murasaki

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1.68.6-14+b1	629,6 Кб	4 400,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.68.6-14+b1	543,3 Кб	4 319,0 Кб	[список файлов]