Пакет: plink2 (2.00~a6.9-250129+dfsg-1 и другие)

Ссылки для plink2

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код plink2:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.cog-genomics.org]

Подобные пакеты:

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

plink2 is a comprehensive update of plink and plink1.9 with new algorithms and new methods, faster and less memory consumer than the first plink.

Другие пакеты, относящиеся к plink2

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libblas3

Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

или libblas.so.3

виртуальный пакет, предоставляемый libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
dep: liblapack3

Library of linear algebra routines 3 - shared version

или liblapack.so.3

виртуальный пакет, предоставляемый liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libzstd1 (>= 1.5.5)

fast lossless compression algorithm
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

Загрузка plink2

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	2.00~a6.9-250129+dfsg-1+b1	2 672,7 Кб	18 113,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.00~a6.9-250129+dfsg-1+b1	1 054,4 Кб	2 778,0 Кб	[список файлов]