Пакет: porechop (0.2.4+dfsg-6 и другие)

Ссылки для porechop

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код porechop:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [rrwick.github.io]

Подобные пакеты:

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Другие пакеты, относящиеся к porechop

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (>= 3~)

Загрузка porechop

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	0.2.4+dfsg-6	55,9 Кб	238,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.2.4+dfsg-6+b2	53,3 Кб	227,0 Кб	[список файлов]