Пакет: sibelia (3.0.7+dfsg-3 и другие)

Ссылки для sibelia

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код sibelia:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [bioinf.spbau.ru]

Подобные пакеты:

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Другие пакеты, относящиеся к sibelia

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: lagan

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [arm64]
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [amd64]
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

sug: sibelia-examples

comparative genomics tool (example data)

Загрузка sibelia

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3.0.7+dfsg-3	309,7 Кб	1 176,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.0.7+dfsg-3+b2	293,4 Кб	1 229,0 Кб	[список файлов]