Пакет: spoa (4.1.4-2 и другие)

Ссылки для spoa

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код spoa:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Другие пакеты, относящиеся к spoa

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

SIMD partial order alignment library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

Загрузка spoa

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	4.1.4-2+b1	37,4 Кб	79,0 Кб	[список файлов]
arm64	4.1.4-2+b1	36,1 Кб	99,0 Кб	[список файлов]