Paket: beagle (241217-3)

Länkar för beagle

eLxr Patch Tracker

Hämta källkodspaketet beagle:

[beagle_241217-3.debian.tar.xz]
[beagle_241217-3.dsc]
[beagle_241217.orig.tar.xz]

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team
Dylan Aïssi

Externa resurser:

Hemsida [faculty.washington.edu]

Liknande paket:

bio-eagle
bio-eagle-examples
minimac4
shapeit4-example
shapeit4
r-cran-qtl
r-cran-haplo.stats
r-cran-tigger
thesias
r-cran-genetics
r-cran-mice

Genotype calling, genotype phasing and imputation of ungenotyped markers

Beagle performs genotype calling, genotype phasing, imputation of ungenotyped markers, and identity-by-descent segment detection. Genotypic imputation works on phased haplotypes using a Li and Stephens haplotype frequency model. Beagle also implements the Refined IBD algorithm for detecting homozygosity-by-descent (HBD) and identity-by-descent (IBD) segments.

Andra paket besläktade med beagle

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: default-jre

Standard Java or Java compatible Runtime
dep: libhtsjdk-java

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

sug: beagle-doc

Documentation for Beagle

Hämta beagle

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
all	369,0 kbyte	768,0 kbyte	[filförteckning]