Paket: canu (2.0+dfsg-2 und andere)

Links für canu

eLxr Patch-Überblick

Quellcode-Paket canu herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team

Externe Ressourcen:

Homepage [canu.readthedocs.org]

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

Andere Pakete mit Bezug zu canu

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: mhap

Paket nicht verfügbar
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: nanopolish

Paket nicht verfügbar
sug: pbgenomicconsensus

Paket nicht verfügbar

canu herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	2.0+dfsg-2+b1	1.182,4 kB	8.799,0 kB	[Liste der Dateien]