Paquet : canu (2.0+dfsg-2 et autres)

Liens pour canu

Suivis des correctifs pour eLxr

Télécharger le paquet source canu :

Responsable :

Debian Med Packaging Team

Ressources externes :

Page d'accueil [canu.readthedocs.org]

Paquets similaires :

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

Autres paquets associés à canu

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: mhap

Paquet indisponible
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: nanopolish

Paquet indisponible
sug: pbgenomicconsensus

Paquet indisponible

Télécharger canu

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2.0+dfsg-2+b1	1 182,4 ko	8 799,0 ko	[liste des fichiers]