Paket: allelecount (4.3.0-3)

Links für allelecount

eLxr Patch-Überblick

Quellcode-Paket allelecount herunterladen:

[allelecount_4.3.0-3.debian.tar.xz]
[allelecount_4.3.0-3.dsc]
[allelecount_4.3.0.orig.tar.gz]

Betreuer:

Debian Med Packaging Team
Andreas Tille

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

Andere Pakete mit Bezug zu allelecount

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats

allelecount herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	29,5 kB	92,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	28,6 kB	120,0 kB	[Liste der Dateien]