Paquet : maq (0.7.1-10)

Liens pour maq

Suivis des correctifs pour eLxr

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Ressources externes :

Page d'accueil [maq.sourceforge.net]

Paquets similaires :

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Autres paquets associés à maq

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64]

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU Standard C++ Library v3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

compression library - runtime

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	295,1 ko	545,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	287,3 ko	581,0 ko	[liste des fichiers]