Paquet : velvet (1.2.10+dfsg1-9)

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Paquets similaires :

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Autres paquets associés à velvet

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

compression library - runtime

sug: velvet-example

Example data for the Velvet sequence assembler

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	662,2 ko	1 276,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	642,6 ko	1 399,0 ko	[liste des fichiers]