Пакет: velvet (1.2.10+dfsg1-9)

Ссылки для velvet

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код velvet:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Другие пакеты, относящиеся к velvet

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

compression library - runtime

sug: velvet-example

Example data for the Velvet sequence assembler

Загрузка velvet

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	662,2 Кб	1 276,0 Кб	[список файлов]
arm64	642,6 Кб	1 399,0 Кб	[список файлов]