パッケージ: boxshade (3.3.1-14 など)

boxshade に関するリンク

eLxr パッチ追跡システム

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.ch.embnet.org]

類似のパッケージ:

Pretty-printing of multiple sequence alignments

Boxshade is a program for creating good looking printouts from multiple-aligned protein or DNA sequences. The program does not perform the alignment by itself and requires as input a file that was created by a multiple alignment program or manually edited with respective tools.

Boxshade reads multiple-aligned sequences from either PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data and ESEE-save files (limited to a maximum of 150 sequences with up to 10000 elements each). Various kinds of shading can be applied to identical/similar residues. Output is written to screen or to a file in the following formats: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

その他の boxshade 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [arm64]

sug: kalign

Global and progressive multiple sequence alignment

または clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

または mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

または hmmer

profile hidden Markov models for protein sequence analysis
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX additional packages
sug: xfig

Facility for Interactive Generation of figures under X11

boxshade のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	3.3.1-14	54.5 kB	161.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	3.3.1-14+b1	50.4 kB	192.0 kB	[ファイル一覧]