Pakiet: ampliconnoise (1.29-15 i inne)

Odnośniki dla ampliconnoise

Śledzenie łatek systemu eLxr

Pobieranie pakietu źródłowego ampliconnoise:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons

AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:

Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences

Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.

Inne pakiety związane z ampliconnoise

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)

high performance message passing library -- shared library
dep: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

rec: mpi-default-bin

Standard MPI runtime programs (metapackage)

Pobieranie ampliconnoise

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.29-15+b1	1 084,5 KiB	2 052,0 KiB	[lista plików]