Pacote: canu (2.0+dfsg-2 e outros)

Links para canu

Rastreador de patch eLxr

Baixe o pacote-fonte canu:

Mantenedor(a):

Debian Med Packaging Team

Fontes externas:

Pagina principal [canu.readthedocs.org]

Pacotes similares:

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

Outros pacotes relacionados a canu

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
também um pacote virtual fornecido por gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: mhap

Pacote não disponível
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: nanopolish

Pacote não disponível
sug: pbgenomicconsensus

Pacote não disponível

Download de canu

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	2.0+dfsg-2+b1	1,182.4 kB	8,799.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.0+dfsg-2+b1	1,077.8 kB	9,886.0 kB	[lista de arquivos]