Пакет: abyss (2.3.5+dfsg-2)

Ссылки для abyss

Отслеживание заплат eLxr

Исходный код abyss:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Другие пакеты, относящиеся к abyss

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: bsdextrautils

extra utilities from 4.4BSD-Lite
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

high performance message passing library -- shared library
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

SQLite 3 shared library
dep: libstdc++6 (>= 12)

GNU Standard C++ Library v3
dep: make

utility for directing compilation
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries
dep: openmpi-common

high performance message passing library -- common files
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

Загрузка abyss

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3 116,2 Кб	9 583,0 Кб	[список файлов]