eLxr packages [ bianca ]
[ Источник: abyss ]
Пакет: abyss (2.3.10-1 и другие)
Ссылки для abyss
Исходный код abyss:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
de novo, parallel, sequence assembler for short reads
ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.
Другие пакеты, относящиеся к abyss
|
|
|
|
-
- dep: bsdextrautils
- extra utilities from 4.4BSD-Lite
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC support library
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)
- SQLite 3 shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: make
- utility for directing compilation
-
- dep: openmpi-bin
- high performance message passing library -- binaries
-
- dep: openmpi-common
- high performance message passing library -- common files
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
Загрузка abyss
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.3.10-1+b1 | 3 246,5 Кб | 10 021,0 Кб | [список файлов] |