Paket: ggd-utils (1.0.0+ds-1 och andra)

Länkar för ggd-utils

eLxr Patch Tracker

Hämta källkodspaketet ggd-utils:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Andra paket besläktade med ggd-utils

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

Hämta ggd-utils

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.0.0+ds-1+b17	2.207,2 kbyte	6.605,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.0.0+ds-1+b17	1.894,2 kbyte	6.162,0 kbyte	[filförteckning]