Paquet : miniasm (0.3+dfsg-4)

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Paquets similaires :

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Autres paquets associés à miniasm

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	29,2 ko	71,0 ko	[liste des fichiers]