Pakiet: miniasm (0.3+dfsg-4)

Odnośniki dla miniasm

Śledzenie łatek systemu eLxr

Pobieranie pakietu źródłowego miniasm:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Inne pakiety związane z miniasm

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Pobieranie miniasm

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	29,2 KiB	71,0 KiB	[lista plików]