eLxr packages [ aria ]
[ bianca ]
[ Bron: augur ]
Pakket: augur (20.0.0-1)
Verwijzigingen voor augur
Het bronpakket augur downloaden:
Beheerders:
Externe bronnen:
- Homepage [github.com]
Vergelijkbare pakketten:
pipeline components for real-time virus analysis
The nextstrain project is an attempt to make flexible informatic pipelines and visualization tools to track ongoing pathogen evolution as sequence data emerges. The nextstrain project derives from nextflu, which was specific to influenza evolution.
nextstrain is comprised of three components:
* fauna: database and IO scripts for sequence and serological data * augur: informatic pipelines to conduct inferences from raw data * auspice: web app to visualize resulting inferences
Andere aan augur gerelateerde pakketten
|
|
|
|
-
- dep: fasttree
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: mafft
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-bcbio-gff
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-biopython
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-boto3
- Python interface to Amazon's Web Services - Python 3.x
-
- dep: python3-cvxopt
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-dendropy
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-ipdb
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-isodate
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-jsonschema
- An(other) implementation of JSON Schema (Draft 3, 4, 6, 7)
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-packaging
- core utilities for python3 packages
-
- dep: python3-pandas
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-pyfastx
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-schedule
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-seaborn
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-treetime (>= 0.9.4)
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-xopen (>= 1.7.0-1~)
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: python3-zstandard
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: raxml
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: seqmagick
- Pakket niet beschikbaar
-
- dep: vcftools
- Pakket niet beschikbaar
-
- rec: iqtree
- Pakket niet beschikbaar