eLxr packages [ aria ]
[ bianca ]
[ Източник: augur ]
Пакет: augur (20.0.0-1)
Връзки за augur
Изтегляне на пакет-източник augur.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
pipeline components for real-time virus analysis
The nextstrain project is an attempt to make flexible informatic pipelines and visualization tools to track ongoing pathogen evolution as sequence data emerges. The nextstrain project derives from nextflu, which was specific to influenza evolution.
nextstrain is comprised of three components:
* fauna: database and IO scripts for sequence and serological data * augur: informatic pipelines to conduct inferences from raw data * auspice: web app to visualize resulting inferences
Други пакети, свързани с augur
|
|
|
|
-
- dep: fasttree
- Пакетът не е наличен
-
- dep: mafft
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-bcbio-gff
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-biopython
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-boto3
- Python interface to Amazon's Web Services - Python 3.x
-
- dep: python3-cvxopt
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-dendropy
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-ipdb
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-isodate
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-jsonschema
- An(other) implementation of JSON Schema (Draft 3, 4, 6, 7)
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-packaging
- core utilities for python3 packages
-
- dep: python3-pandas
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-pyfastx
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-schedule
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-seaborn
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-treetime (>= 0.9.4)
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-xopen (>= 1.7.0-1~)
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-zstandard
- Пакетът не е наличен
-
- dep: raxml
- Пакетът не е наличен
-
- dep: seqmagick
- Пакетът не е наличен
-
- dep: vcftools
- Пакетът не е наличен
-
- rec: iqtree
- Пакетът не е наличен
Изтегляне на augur
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| all | 182,9 кБ | 829,0 кБ | [списък на файловете] |