Pakiet: skewer (0.2.2-6 i inne)

Odnośniki dla skewer

Śledzenie łatek systemu eLxr

Pobieranie pakietu źródłowego skewer:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Inne pakiety związane z skewer

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3

Pobieranie skewer

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.2.2-6+b1	86,4 KiB	216,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.2.2-6+b2	79,1 KiB	236,0 KiB	[lista plików]