Balík: skewer (0.2.2-6 a iné)

Odkazy pre skewer

Sledovanie záplat eLxr

Stiahnuť zdrojový balík skewer:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Ostatné balíky súvisiace s balíkom skewer

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3

Stiahnuť skewer

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	0.2.2-6+b1	86.4 kB	216.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.2.2-6+b2	79.1 kB	236.0 kB	[zoznam súborov]