Balík: miniasm (0.3+dfsg-4 a iné)

Odkazy pre miniasm

Sledovanie záplat eLxr

Stiahnuť zdrojový balík miniasm:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom miniasm

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Stiahnuť miniasm

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	0.3+dfsg-4	29.2 kB	71.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.3+dfsg-4+b1	27.2 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]