Paket: miniasm (0.3+dfsg-4 och andra)

Länkar för miniasm

eLxr Patch Tracker

Hämta källkodspaketet miniasm:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Andra paket besläktade med miniasm

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Hämta miniasm

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	0.3+dfsg-4	29,2 kbyte	71,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.3+dfsg-4+b1	27,2 kbyte	84,0 kbyte	[filförteckning]