Пакет: miniasm (0.3+dfsg-4 и други)

Връзки за miniasm

Управление на кръпките в eLxr

Изтегляне на пакет-източник miniasm.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Други пакети, свързани с miniasm

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Изтегляне на miniasm

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	0.3+dfsg-4	29,2 кБ	71,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.3+dfsg-4+b1	27,2 кБ	84,0 кБ	[списък на файловете]