eLxr packages [ aria ]
[ bianca ]
[ Източник: cnvkit ]
Пакет: cnvkit (0.9.9-2 и други)
Връзки за cnvkit
Изтегляне на пакет-източник cnvkit.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [cnvkit.readthedocs.org]
Подобни пакети:
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
A command-line toolkit and Python library for detecting copy number variants and alterations genome-wide from targeted DNA sequencing. It is designed for use with hybrid capture, including both whole-exome and custom target panels, and short-read sequencing platforms such as Illumina and Ion Torrent.
Други пакети, свързани с cnvkit
|
|
|
|
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-joblib
- tools to provide lightweight pipelining in Python
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-pandas
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-pomegranate
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-pyfaidx
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-pysam
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-reportlab
- ReportLab library to create PDF documents using Python3
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-sklearn
- Python modules for machine learning and data mining - Python 3
-
- dep: r-bioc-dnacopy
- Пакетът не е наличен
Изтегляне на cnvkit
| Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.9.9-2+b1 | 15 064,0 кБ | 69 065,0 кБ | [списък на файловете] |