Pakiet: megadepth (1.2.0-4 i inne)

Odnośniki dla megadepth

Śledzenie łatek systemu eLxr

Pobieranie pakietu źródłowego megadepth:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

computes coverage from BigWig and BAM sequencing files

A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.

This package is a successor of the program 'bamcount'.

Inne pakiety związane z megadepth

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)

C library for handling bigWig files
dep: libc6 (>= 2.34) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3

sug: r-bioc-megadepth

BioCOnductor BigWig and BAM related utilities

Pobieranie megadepth

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.2.0-4+b1	81,0 KiB	275,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.2.0-4+b2	72,4 KiB	275,0 KiB	[lista plików]