Balík: pizzly (0.37.3+ds-9 a iné)

Odkazy pre pizzly

Sledovanie záplat eLxr

Stiahnuť zdrojový balík pizzly:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

Identifies gene fusions in RNA sequencing data

For the interpretation of the transcriptome (the abundance and sequence of RNA) of tomour cells one is particularly interested in transcripts that cannot be mapped to single genes but that are seen to be fused as parts from two genes. Likely eplanations are chromosomal translocations.

Pizzly can identify novel such peculiarities, building on interpretations on variable splicing by the tool kallisto. Both tools are elements of the bcbio workflow.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom pizzly

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: kallisto

near-optimal RNA-Seq quantification
dep: libc6 (>= 2.34) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 12) [amd64]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64]
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

rec: python3-h5py

general-purpose Python interface to hdf5

Stiahnuť pizzly

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	0.37.3+ds-9	285.5 kB	864.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.37.3+ds-9+b2	262.0 kB	929.0 kB	[zoznam súborov]