eLxr packages [ aria ]
[ bianca ]
[ Pakiet źródłowy: augur ]
Pakiet: augur (20.0.0-1)
Odnośniki dla augur
Pobieranie pakietu źródłowego augur:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
pipeline components for real-time virus analysis
The nextstrain project is an attempt to make flexible informatic pipelines and visualization tools to track ongoing pathogen evolution as sequence data emerges. The nextstrain project derives from nextflu, which was specific to influenza evolution.
nextstrain is comprised of three components:
* fauna: database and IO scripts for sequence and serological data * augur: informatic pipelines to conduct inferences from raw data * auspice: web app to visualize resulting inferences
Inne pakiety związane z augur
|
|
|
|
-
- dep: fasttree
- Pakiet niedostępny
-
- dep: mafft
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-bcbio-gff
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-biopython
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-boto3
- Python interface to Amazon's Web Services - Python 3.x
-
- dep: python3-cvxopt
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-dendropy
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-ipdb
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-isodate
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-jsonschema
- An(other) implementation of JSON Schema (Draft 3, 4, 6, 7)
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-packaging
- core utilities for python3 packages
-
- dep: python3-pandas
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-pyfastx
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-schedule
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-seaborn
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-treetime (>= 0.9.4)
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-xopen (>= 1.7.0-1~)
- Pakiet niedostępny
-
- dep: python3-zstandard
- Pakiet niedostępny
-
- dep: raxml
- Pakiet niedostępny
-
- dep: seqmagick
- Pakiet niedostępny
-
- dep: vcftools
- Pakiet niedostępny
-
- rec: iqtree
- Pakiet niedostępny
Pobieranie augur
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| all | 182,9 KiB | 829,0 KiB | [lista plików] |