eLxr packages [ aria ]
[ bianca ]
[ Source: augur ]
Пакунок: augur (20.0.0-1)
Links for augur
Download Source Package augur:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
pipeline components for real-time virus analysis
The nextstrain project is an attempt to make flexible informatic pipelines and visualization tools to track ongoing pathogen evolution as sequence data emerges. The nextstrain project derives from nextflu, which was specific to influenza evolution.
nextstrain is comprised of three components:
* fauna: database and IO scripts for sequence and serological data * augur: informatic pipelines to conduct inferences from raw data * auspice: web app to visualize resulting inferences
Інші пакунки пов'язані з augur
|
|
|
|
-
- dep: fasttree
- Пакунок недоступний
-
- dep: mafft
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-bcbio-gff
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-biopython
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-boto3
- Python interface to Amazon's Web Services - Python 3.x
-
- dep: python3-cvxopt
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-dendropy
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-ipdb
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-isodate
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-jsonschema
- An(other) implementation of JSON Schema (Draft 3, 4, 6, 7)
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-packaging
- core utilities for python3 packages
-
- dep: python3-pandas
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-pyfastx
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-schedule
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-seaborn
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-treetime (>= 0.9.4)
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-xopen (>= 1.7.0-1~)
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3-zstandard
- Пакунок недоступний
-
- dep: raxml
- Пакунок недоступний
-
- dep: seqmagick
- Пакунок недоступний
-
- dep: vcftools
- Пакунок недоступний
-
- rec: iqtree
- Пакунок недоступний
Завантажити augur
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| all | 182.9 kB | 829.0 kB | [список файлів] |