[ bianca ]
[ aria ]
[ Fonte: augur ]
Pacote: augur (20.0.0-1)
Links para augur
Baixe o pacote-fonte augur:
Mantenedores(as):
Fontes externas:
- Pagina principal [github.com]
Pacotes similares:
pipeline components for real-time virus analysis
The nextstrain project is an attempt to make flexible informatic pipelines and visualization tools to track ongoing pathogen evolution as sequence data emerges. The nextstrain project derives from nextflu, which was specific to influenza evolution.
nextstrain is comprised of three components:
* fauna: database and IO scripts for sequence and serological data * augur: informatic pipelines to conduct inferences from raw data * auspice: web app to visualize resulting inferences
Outros pacotes relacionados a augur
|
|
|
|
-
- dep: fasttree
- Pacote não disponível
-
- dep: mafft
- Pacote não disponível
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-bcbio-gff
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-biopython
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-boto3
- Python interface to Amazon's Web Services - Python 3.x
-
- dep: python3-cvxopt
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-dendropy
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-ipdb
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-isodate
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-jsonschema
- An(other) implementation of JSON Schema (Draft 3, 4, 6, 7)
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-packaging
- core utilities for python3 packages
-
- dep: python3-pandas
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-pyfastx
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-schedule
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-seaborn
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-treetime (>= 0.9.4)
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-xopen (>= 1.7.0-1~)
- Pacote não disponível
-
- dep: python3-zstandard
- Pacote não disponível
-
- dep: raxml
- Pacote não disponível
-
- dep: seqmagick
- Pacote não disponível
-
- dep: vcftools
- Pacote não disponível
-
- rec: iqtree
- Pacote não disponível
Download de augur
| Arquitetura | Tamanho do pacote | Tamanho instalado | Arquivos |
|---|---|---|---|
| all | 182.9 kB | 829.0 kB | [lista de arquivos] |